Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Ggta1P23336 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ggta1P23336 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Ggta1P23336 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ggta1P23336 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ggta1P23336 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ggta1P23336 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggta1P23336 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ggta1P23336 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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Ggta1P23336 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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