Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmnb2P21619 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmnb2P21619 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmnb2P21619 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms