Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcaP20444 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcaP20444 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcaP20444 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.3 ms