Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18532 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18532 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P18532 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P18532 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18532 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18532 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P18532 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18532 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18532 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18532 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P18532 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18532 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18532 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms