Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ass1P16460 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ass1P16460 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ass1P16460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ass1P16460 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ass1P16460 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms