Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CnpP16330 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CnpP16330 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CnpP16330 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CnpP16330 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CnpP16330 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CnpP16330 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CnpP16330 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CnpP16330 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CnpP16330 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CnpP16330 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CnpP16330 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CnpP16330 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CnpP16330 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CnpP16330 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CnpP16330 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CnpP16330 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnpP16330 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnpP16330 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnpP16330 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CnpP16330 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CnpP16330 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CnpP16330 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CnpP16330 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CnpP16330 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CnpP16330 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CnpP16330 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CnpP16330 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms