Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrphP15331 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrphP15331 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrphP15331 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrphP15331 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrphP15331 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrphP15331 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrphP15331 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrphP15331 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrphP15331 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrphP15331 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrphP15331 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrphP15331 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrphP15331 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrphP15331 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrphP15331 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrphP15331 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrphP15331 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrphP15331 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms