Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcl1P12850 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl1P12850 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms