Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrm1P12657 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrm1P12657 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms