Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fv4P11370 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fv4P11370 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fv4P11370 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fv4P11370 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fv4P11370 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms