Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsbP10605 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsbP10605 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsbP10605 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsbP10605 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms