Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PolP10400 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PolP10400 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PolP10400 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PolP10400 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PolP10400 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PolP10400 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP10400 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP10400 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP10400 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolP10400 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolP10400 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolP10400 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolP10400 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolP10400 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolP10400 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PolP10400 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PolP10400 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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