Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Schip1P0DPB4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Schip1P0DPB4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms