Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6c1P0CW02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6c1P0CW02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6c1P0CW02 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms