Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UbbP0CG49 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UbbP0CG49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UbbP0CG49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms