Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb2P0C1T1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb2P0C1T1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb2P0C1T1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms