Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3P09920 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Csf3P09920 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf3P09920 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csf3P09920 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csf3P09920 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms