Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd3P09027 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd3P09027 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms