Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp1P08042 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp1P08042 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp1P08042 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zfp1P08042 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp1P08042 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp1P08042 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp1P08042 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp1P08042 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp1P08042 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp1P08042 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp1P08042 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zfp1P08042 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms