Protein–RNA interactions for Protein: P07742

Rrm1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm1P07742 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rrm1P07742 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrm1P07742 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrm1P07742 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms