Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csn3P06796 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csn3P06796 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csn3P06796 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms