Protein–RNA interactions for Protein: P04344

Crygb, Gamma-crystallin B, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygbP04344 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrygbP04344 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygbP04344 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CrygbP04344 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CrygbP04344 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms