Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P04214 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P04214 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P04214 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P04214 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04214 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04214 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04214 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04214 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04214 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P04214 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04214 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
P04214 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04214 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04214 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04214 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04214 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04214 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04214 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04214 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P04214 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P04214 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04214 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04214 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04214 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04214 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04214 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04214 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04214 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04214 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04214 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04214 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04214 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04214 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04214 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04214 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04214 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04214 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04214 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04214 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04214 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04214 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04214 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms