Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tk1P04184 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tk1P04184 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tk1P04184 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tk1P04184 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms