Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-Ab1P01921 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-Ab1P01921 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms