Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01853 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01853 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01853 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01853 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01853 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01853 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01853 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01853 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01853 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01853 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01853 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01853 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01853 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms