Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01821 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01821 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01821 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01821 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01821 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01821 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01821 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01821 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01821 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01821 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P01821 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P01821 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01821 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms