Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01738 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01738 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01738 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01738 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01738 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01738 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01738 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01738 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01738 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01738 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01738 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms