Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01667 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01667 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01667 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01667 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01667 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01667 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01667 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01667 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01667 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01667 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01667 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01667 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01667 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01667 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01667 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01667 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01667 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01667 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
P01667 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
P01667 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
P01667 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
P01667 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms