Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01649 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01649 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01649 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01649 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01649 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01649 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01649 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01649 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01649 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01649 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01649 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01649 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01649 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01649 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01649 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01649 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01649 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01649 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms