Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MscO88940 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MscO88940 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MscO88940 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MscO88940 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MscO88940 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MscO88940 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MscO88940 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MscO88940 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MscO88940 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MscO88940 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MscO88940 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MscO88940 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MscO88940 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MscO88940 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MscO88940 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MscO88940 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms