Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3bO88509 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnmt3bO88509 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnmt3bO88509 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms