Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkcO88445 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkcO88445 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkcO88445 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AurkcO88445 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkcO88445 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AurkcO88445 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AurkcO88445 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AurkcO88445 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms