Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnal1O88327 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnnal1O88327 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms