Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx12O70493 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx12O70493 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx12O70493 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx12O70493 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx12O70493 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms