Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sap18O55128 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sap18O55128 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms