Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1i2O54915 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1i2O54915 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1i2O54915 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms