Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Limk2O54785 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Limk2O54785 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Limk2O54785 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Limk2O54785 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Limk2O54785 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Limk2O54785 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Limk2O54785 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms