Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc4O35988 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc4O35988 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdc4O35988 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdc4O35988 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sdc4O35988 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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