Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pik3cdO35904 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pik3cdO35904 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms