Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NudcO35685 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NudcO35685 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NudcO35685 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NudcO35685 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NudcO35685 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NudcO35685 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NudcO35685 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NudcO35685 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NudcO35685 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NudcO35685 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NudcO35685 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NudcO35685 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NudcO35685 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NudcO35685 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NudcO35685 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NudcO35685 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NudcO35685 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NudcO35685 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NudcO35685 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NudcO35685 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NudcO35685 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NudcO35685 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NudcO35685 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NudcO35685 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NudcO35685 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NudcO35685 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NudcO35685 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NudcO35685 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NudcO35685 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NudcO35685 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms