Protein–RNA interactions for Protein: O35618

Mdm4, Protein Mdm4, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm4O35618 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm4O35618 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm4O35618 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm4O35618 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms