Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx1aO35526 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stx1aO35526 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx1aO35526 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms