Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clcn6O35454 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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