Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfrsf11aO35305 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfrsf11aO35305 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.8 ms