Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pkd2O35245 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pkd2O35245 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pkd2O35245 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pkd2O35245 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms