Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casq1O09165 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casq1O09165 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casq1O09165 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casq1O09165 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casq1O09165 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms