Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4dO09126 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4dO09126 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms