Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eftud2O08810 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Eftud2O08810 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eftud2O08810 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eftud2O08810 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eftud2O08810 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eftud2O08810 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eftud2O08810 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eftud2O08810 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eftud2O08810 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eftud2O08810 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eftud2O08810 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eftud2O08810 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eftud2O08810 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eftud2O08810 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms