Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltaO08585 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltaO08585 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CltaO08585 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltaO08585 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltaO08585 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltaO08585 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltaO08585 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltaO08585 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltaO08585 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CltaO08585 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CltaO08585 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CltaO08585 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltaO08585 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltaO08585 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltaO08585 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltaO08585 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltaO08585 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltaO08585 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltaO08585 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltaO08585 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltaO08585 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltaO08585 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltaO08585 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CltaO08585 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltaO08585 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltaO08585 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltaO08585 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltaO08585 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltaO08585 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltaO08585 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltaO08585 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltaO08585 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltaO08585 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltaO08585 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltaO08585 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltaO08585 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltaO08585 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltaO08585 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltaO08585 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms